Classification des champignons
L'ensemble des conditions du milieu qui détermine le mode de vie, l'aire de répartition et l'abondance des populations d'une espèce fongique donnée est appelé biotope de l'espèce. Les biotopes des différentes espèces sont de tailles différentes. Plus le biotope est petit, plus les chances de dispersion de l'espèce sont faibles, et cela détermine la survie de cette espèce, voire d'un seul de ses individus. C'est pourquoi chaque espèce, comme instruite par la nature, s'efforce par tous les moyens dont elle dispose de préserver ses propriétés innées, de les perfectionner, en cherchant d'une manière ou d'une autre à élargir les limites de son biotope, mais jamais à les restreindre.
La dispersion des champignons et leur adaptation à un biotope donné sont déterminées par les facteurs suivants, assez importants : la structure hyphale du thalle fongique, sa forme de croissance, le contact du thalle avec le substrat, le métabolisme actif de ses cellules, la conquête rapide du substrat, une grande capacité d'adaptation et l'aptitude à produire des substances toxiques afin de préserver ou d'étendre son habitat.
Pour mieux comprendre les relations entre les différentes espèces fongiques, les champignons eux-mêmes, leur mode de vie, leur impact sur l'environnement et les possibilités de leur utilisation, il faut d'abord étudier les espèces fongiques, déterminer leur nombre, et seulement ensuite les classer, c'est-à-dire construire un système du règne fongique.
Pour désigner les noms des champignons, comme pour les plantes, les animaux et les autres organismes vivants, la littérature scientifique comme la littérature de vulgarisation utilise la nomenclature binaire (double) introduite par C. Linné en 1733. Chaque champignon (plante et animal) est nommé en latin par deux mots. Par exemple, dans Boletus aereus – le cèpe bronzé (tête-de-nègre) – le premier mot est le nom du genre, toujours écrit avec une majuscule, et le second est le nom de l'espèce, écrit avec une minuscule.
Le système naturel des champignons (comme celui de tout le monde vivant) n'existe que dans la nature, tandis que les scientifiques, sur la base des données disponibles et de connaissances bien fondées, tentent simplement de créer une classification artificielle aussi parfaite et convaincante que possible. À l'heure actuelle, plusieurs systèmes de classification des champignons ont été publiés ; les mycologues les comprennent différemment et les interprètent de diverses manières. Il n'existe encore aucun système unique des champignons acceptable par tous les mycologues.
Selon la classification la plus récente, publiée en 1995, le monde des champignons a été divisé en 11 divisions. Cependant, à peine cinq ans plus tard, avec l'accumulation de nouveaux faits scientifiques, ce système a été précisé et corrigé. La classification des champignons donnée par Moreau, 1978 reste populaire dans la littérature mycologique aujourd'hui encore. Les champignons mitosporiques sont dépourvus de stade sexué ou l'ont perdu (principalement des ascomycètes ou certains basidiomycètes), et ne forment donc pas une division distincte. Dans la littérature plus ancienne, ils étaient placés dans une division à part (Deuteromycota). Récemment, les myxomycètes (Myxomycota) ont été transférés dans le règne des Protista, et les oomycètes (Oomycota) dans le règne des Stramenopila.
Le fondateur de la systématique du règne fongique est considéré comme étant le botaniste suédois Elias Fries (E. Fries, 1794–1878). En 1821–1822, dans son ouvrage « Systema mycologicum », il présenta un système des champignons dont les fondements ne sont pas dépassés encore aujourd'hui.